アブレーションはラテン語起源で、破壊、排除を意味します。心臓病（循環器科）で私たちが使用する方法は、一般的にカテーテルアブレーションです。 EPS セクションで説明した電極カテーテルとは少し異なる形式の特殊なカテーテル (アブレーション カテーテル) を使用して、心臓内の不整脈を引き起こす 3 ～ 5 mm の領域を破壊します。このようにして、例えば、動悸（頻脈）を引き起こす焦点を取り除くことによって、患者は動悸の問題を取り除くことができる。この治療法は、EPSと呼ばれる手順の継続として、または2回目のセッションで実行されます。このプロセスは EPS と同様に行われます。患者は 2 つの手順の違いを区別できません。アブレーションだけの施術時間は1～2時間程度かかる場合があります。その理由は、頻脈を引き起こす病巣が小さく、それを破壊するのにEPSよりも時間がかかるためです。破壊プロセスは、高周波電流による加熱または極低温エネルギーによる凍結によって行われます。施術は基本的に無痛です。したがって、全身麻酔下では行われません。手術時間が長く、心臓の一部が少し痛むという理由だけで、静脈内鎮静剤がより頻繁に使用されます。処置後、患者は（薬を使わずに）動悸を完全に取り除くことができます。この点において、この治療法は、多くの病気に対する数ある治療法の中でも、完全治癒（完治）が可能な数少ない治療法の一つと言えます。
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